米田 一成

米田 一成

ヨネダ カズナリ

  • 教授
  • 学位:博士(工学)

基本情報

所属

  • 農学部 / バイオサイエンス学科
  • 生物科学研究科 / 生物科学専攻
  • 農学研究科 / 農学専攻

ジャンル

  • 生物・動植物

研究内容

酵素

生体内で起こる化学反応を触媒するタンパク質を酵素と呼びます。酵素は発酵食品や医薬品など私達の身の回りで昔からたくさん利用されています。酵素は顕微鏡では見えないくらい小さな生体分子ですが、特定の立体構造を正しく取ることによってはじめて働くことができます。多くの病気は酵素が正しく働かないことにより生じるため、酵素の機能(働き)や、立体構造(形)を明らかにすることは新しい治療薬を作り出すことにもつながります。
生物化学研究室では、藍染めや植物の疫病に関わる酵素に焦点を当て、酵素の機能や立体構造を明らかにすることで、生化学的な視点で藍染めを解明したり、植物病原菌に対する新しい農薬の開発を行っています。また、酵素反応を抗がん剤などの有用化合物の合成へ応用する研究も行っています。酵素の唯一の弱点として安定性の低さが挙げられますが、温泉などで生息する好熱菌が生産する酵素の安定性が非常に高いことに着目して耐熱性の酵素を利用することでこれらの弱点が克服できると考えて研究を行っています。

酵素

詳細情報

研究キーワード

  • 酵素化学
  • 酵素工学
  • 生化学
  • タンパク質工学
  • 構造生物学
  • 極限環境微生物学
  • 遺伝子工学
  • 応用微生物学
  • 遺伝子資源学
  • ビタミン生合成

研究分野

  • ライフサイエンス 機能生物化学
  • ライフサイエンス 応用生物化学
  • ライフサイエンス 応用微生物学
  • ライフサイエンス 構造生物化学

委員歴

  • 日本ビタミン学会 将来構想検討委員
  • 日本ビタミン学会 ビタミン学会代議員
  • 日本農芸化学会 平成30年度西日本支部大会(西日本支部第 324 回講演会), 実行委員, 広報

受賞

  • 松前重義学術奨励賞: ユニークなアミノ酸配列を有す新規なNAD依存性脱水素酵素の構造生物工学的研究
  • 日本ビタミン学会奨励賞: 超好熱アーキアの新規なNAD(P)依存性アミノ酸脱水素酵素の機能と構造解析

論文

Lactobacillus plantarum由来菌体表層グリセルアルデヒド-3-リン酸脱水素酵素の結晶構造解析:水銀結合メカニズムの解明

新規分岐鎖アミノ酸ラセマーゼ,イソロイシン2-エピメラーゼの構造解析

NAD+依存性L-アスパラギン酸脱水素酵素ホモログ遺伝子のクローニングと機能解析

耐熱性カルボニル還元酵素の結晶構造解析と基質認識機構の解明

講演・口頭発表等

  • 好熱性Bacillus smithii由来FMN-NADH依存性インジゴ還元酵素の分子特性
  • Bacillus smithii由来FMN-NADH依存性高度耐熱性インジゴ還元酵素の機能と構造解析
  • Bacillus smithii由来高度耐熱性インジゴ還元酵素の生化学的特性解析
  • Enzymological characterization of class II chitinase from Barley
  • Enzymological characterization of Indigo reductase involved in the Aidate fermentation of Japanese Aizome (indigo dyeing)
  • Enzymological characterization of L-threonine dehydrogenase from Phytophthora infestans
  • オオムギ由来クラスⅡキチナーゼのクローニングと機能解析
  • Bacillus smithii由来FMN-NADH依存性インジゴ還元酵素の機能と構造
  • 植物疫病菌由来NAD(P)+依存性L-スレオニン脱水素酵素の機能・構造解析
  • Geobacillus kaustophilus由来ジアミノピメリン酸脱炭酸酵素の機能解析
  • 超好熱アーキア由来FAD依存性L-プロリン脱水素酵素の構造解析
  • ニワトリリゾチームおよびハマグリリゾチームの構造と機能に関する研究
  • 植物疫病菌由来NAD依存性L-スレオニン脱水素酵素の機能解析
  • 超好熱アーキアPyrobaculum calidifontis由来グリセロール 1-リン酸脱水素酵素に見出した新規補酵素結合様式
  • 超好熱性細菌Thermotoga maritima由来アスパラギン酸キナーゼ/ホモセリンデヒドロゲナーゼ融合酵素(AK/HseDH)の分子特性
  • ニワトリ脂肪肝由来NAD(P)H依存性カルボニル還元酵素の機能改変
  • 新規分岐鎖アミノ酸ラセマーゼ、イソロイシン2-エピメラーゼの構造解析
  • 超好熱アーキアPyrobaculum aerophilum由来galactose-1-phosphate uridylyltransferaseの構造解析
  • 超好熱性細菌Thermotoga maritima由来アスパラギン酸キナーゼ/ホモセリンデヒドロゲナーゼ融合酵素(AK/HseDH)の機能解析
  • Structure and functional analysis of NAD(P)H-dependent carbonyl reductase specifically expressed in thyroidectomized(Tx) chicken fatty liver

担当経験のある科目

  • 生化学特論
  • バイオインフォマティクス演習
  • 代謝化学
  • 生化学

所属学会

  • 日本生化学会
  • 日本生物工学会
  • 日本蛋白質科学会
  • 日本ビタミン学会
  • 日本農芸化学会

Works(作品等)

6JYG:Crystal Structure of L-threonine dehydrogenase from Phytophthora infestans

6JXS:Crystal Structure of Indigo reductase (Y151F) from Bacillus smithii type strain DSM 4216

6JXN:Crystal Structure of Indigo reductase from Bacillus smithii type strain DSM 4216

6IQV:Crystal Structure of Cell Surface Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase Complexed with Hg2+ from Lactobacillus plantarum

6IQM:Crystal Structure of Cell Surface Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase Complexed with NAD+ from Lactobacillus plantarum

5XVH:Crystal structure of the NADP+ and tartrate-bound complex of L-serine 3-dehydrogenase from the hyperthermophilic archaeon Pyrobaculum calidifontis

5B1Y:Crystal structure of NADPH bound carbonyl reductase from Aeropyrum pernix

3WXB:Crystal structure of NADPH bound carbonyl reductase from chicken fatty liver

3WS7:The 1.18 A resolution structure of L-serine 3-dehydrogenase complexed with NADP+ and sulfate ion from the hyperthermophilic archaeon Pyrobaculum calidifontis

3W6Z:Crystal structure of NADP bound L-serine 3-dehydrogenase (K170M) from Hyperthermophilic Archaeon Pyrobaculum calidifontis

3W6U:Crystal structure of NADP bound L-serine 3-dehydrogenase from Hyperthermophilic Archaeon Pyrobaculum calidifontis

3AJR:Crystal structure of L-3-Hydroxynorvaline bound L-Threonine dehydrogenase (Y137F) from Hyperthermophilic Archaeon Thermoplasma volcanium

3A9W:Crystal structure of L-Threonine bound L-Threonine dehydrogenase (Y137F) from Hyperthermophilic Archaeon Thermoplasma volcanium

3A4V:Crystal structure of pyruvate bound L-Threonine dehydrogenase from Hyperthermophilic Archaeon Thermoplasma volcanium

3A1N:Crystal structure of L-Threonine dehydrogenase from Hyperthermophilic Archaeon Thermoplasma volcanium

3ABI Crystal Structure of L-Lysine Dehydrogenase from Hyperthermophilic Archaeon Pyrococcus horikoshii

2YY7 Crystal structure of thermolabile L-threonine dehydrogenase from Flavobacterium frigidimaris KUC-1

2YVS Crystal structure of glycolate oxidase subunit GlcE from Thermus thermophilus HB8

2DC1 Crystal Structure Of L-Aspartate Dehydrogenase From Hyperthermophilic Archaeon Archaeoglobus fulgidus

共同研究・競争的資金等の研究課題

藍建て発酵に関与するインジゴ還元酵素の機能と構造解析並びに染色への応用

特異的農薬開発を指向した新規なL-アミノ酸脱水素酵素の機能解析

新規なL-アミノ酸脱水素酵素の機能と立体構造解析に基づく抗トリパノソーマ薬の開発

超好熱アーキアの補酵素NAD(P)のデノボ生合成系の構造生物学研究

超好熱菌由来de novo NAD生合成関連複合体酵素の構造解析

Crystal structure of novel L-threonine dehydrogenase belongs to the SDR family.

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